| 順位 | 選手名 | 所属名 | レーン | タイム | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 高 村 輝 | 山中湖中学校 | IN | 04:32.89 | |
| 2 | 渡 辺 亮 介 | 山中湖中学校 | OUT | 04:46.63 | |
| 3 | 前 田 幸 成 | 山中湖中学校 | IN | 04:58.31 | |
| 4 | 天 野 拓 也 | 山中湖中学校 | IN | 04:58.79 | |
| 5 | 新 海 史 弥 | 小淵沢中学校 | OUT | 05:04.22 | |
| 6 | 羽 田 泰 輔 | 山中湖中学校 | OUT | 05:04.31 | |
| 7 | 渡 辺 豊 太 | 忍野中学校 | IN | 05:14.48 | |
| 8 | 杉 本 卓 也 | 小淵沢中学校 | IN | 05:40.64 | |
| 9 | 五十嵐 慧 | 小淵沢中学校 | OUT | 05:51.51 | |
| − | 塩 畑 伶 | 勝山中学校 | OUT | WD |