| 順位 | 選手名 | 所属名 | レーン | タイム | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 天 野 拓 也 | 山中湖中学校 | OUT | 00:42.83 | |
| 2 | 大 塚 樹 | 山中湖中学校 | IN | 00:43.50 | |
| 3 | 小 林 諒 | 山中湖中学校 | OUT | 00:43.74 | |
| 4 | 高 村 潤 | 山中湖中学校 | IN | 00:44.22 | |
| 5 | 千 葉 勇次郎 | 山中湖中学校 | IN | 00:46.37 | |
| 6 | 千 葉 瞭太郎 | 山中湖中学校 | OUT | 00:46.81 | |
| 7 | 浅 川 樹 | 泉中学校 | IN | 00:46.84 | |
| 8 | 今 井 功 太 | 小淵沢中学校 | OUT | 00:47.10 | |
| 9 | 進 藤 佑 紀 | 小淵沢中学校 | OUT | 00:47.24 | |
| 10 | 平 島 慎 也 | 小淵沢中学校 | OUT | 00:47.53 | |
| 11 | 青 山 仁 | 勝山中学校 | IN | 00:47.54 | |
| 12 | 竹 原 大 起 | 泉中学校 | IN | 00:47.67 |