| 順位 | 選手名 | 所属名 | レーン | タイム | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 新 海 史 弥 | 小淵沢中学校 | OUT | 04:41.65 | |
| 2 | 千 葉 瞭太郎 | 山中湖中学校 | OUT | 04:46.94 | |
| 3 | 天 野 拓 也 | 山中湖中学校 | OUT | 04:47.33 | |
| 4 | 小 林 諒 | 山中湖中学校 | IN | 04:53.85 | |
| 5 | 大 塚 樹 | 山中湖中学校 | IN | 04:56.19 | |
| 6 | 千 葉 勇次郎 | 山中湖中学校 | IN | 04:58.00 | |
| 7 | 浅 川 樹 | 泉中学校 | IN | 05:06.03 | |
| 8 | 高 村 潤 | 山中湖中学校 | IN | 05:07.09 | |
| 9 | 平 島 慎 也 | 小淵沢中学校 | OUT | 05:07.76 | |
| 10 | 進 藤 佑 紀 | 小淵沢中学校 | OUT | 05:16.02 | |
| 11 | 竹 原 大 起 | 泉中学校 | IN | 05:17.31 | |
| 12 | 今 井 功 太 | 小淵沢中学校 | IN | 05:26.25 | |
| 13 | 青 山 仁 | 勝山中学校 | OUT | 05:30.10 | |
| － | 進 藤 隆 一 | 泉中学校 | OUT | DQ |